El pago de la ayuda aprobada a los proyectos se realizará exclusivamente sobre el reembolso de gastos efectivamente pagados y según el circuito y modelos de certificación de gastos y solicitudes de reembolso que establece la Guía para la Certificación de Gastos aprobada por el Programa.

En el marco del Programa los gastos son elegibles respetando, indispensablemente, el contenido del Reglamento (CE) nº 448/2004 de la Comisión de 10 de marzo de 2004, que modifica el Reglamento 1685/2000 por el que se establecen disposiciones de aplicación del Reglamento (CE) nº 1260/1999 del Consejo en lo relativo a la financiación de gastos de operaciones cofinanciadas por los Fondos Estructurales. La fecha de elegibilidad de los gastos se decide en cada convocatoria y siempre respetando lo consensuado en el seno del partenariado del proyecto.

Cuando cada socio del proyecto (Jefe de Fila y socios) haya efectuado pagos por un importe considerable (6.000 € aproximadamente) elaborará y enviará al Interlocutor Regional de su región una declaración de gastos pagados. El Interlocutor Regional analizará y validará las declaraciones que enviará al Jefe de Fila del proyecto. Entre las obligaciones del Jefe de Fila se encuentra la elaboración y envió al Secretariado Técnico Común de las solicitudes de reembolso de los importes validados de su entidad y de sus socios al porcentaje de reembolso correspondiente.

Todos los reembolsos a los proyectos se efectuarán en la cuenta bancaria indicada por el Jefe de Fila en el formulario de candidatura presentada por el proyecto y el Jefe de Fila repartirá a los socios la cantidad recibida por la Autoridad de Pago del Programa en un plazo máximo de dos semanas.